Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Q3U6N9 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm38330-201ENSMUST00000192743 959 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Q3U6N9 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms