Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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