Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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Ttc39dQ0VF76 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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Ttc39dQ0VF76 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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Ttc39dQ0VF76 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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Ttc39dQ0VF76 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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Ttc39dQ0VF76 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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Ttc39dQ0VF76 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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Ttc39dQ0VF76 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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Ttc39dQ0VF76 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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Ttc39dQ0VF76 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms