Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Adgrg4-206ENSMUST00000168724 531 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm37209-201ENSMUST00000194109 1276 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms