Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 A530017D24Rik-201ENSMUST00000101077 2315 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprmP28828 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm28702-201ENSMUST00000188276 253 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprmP28828 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprmP28828 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprmP28828 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Kcnk10-202ENSMUST00000221240 7460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm24567-201ENSMUST00000179294 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm23943-201ENSMUST00000179712 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm25228-201ENSMUST00000180121 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm23304-201ENSMUST00000180209 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 AC133189.2-201ENSMUST00000228527 392 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Carf-209ENSMUST00000187978 5463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprmP28828 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.8 ms