Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P20040 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
P20040 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
P20040 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
P20040 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
P20040 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
P20040 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
P20040 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
P20040 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
P20040 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
P20040 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
P20040 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
P20040 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
P20040 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
P20040 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
P20040 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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