Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PdgfaP20033 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms