Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Acbd7-201ENSMUST00000115089 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Clip3B9EHT4 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms