Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Olfr741-201ENSMUST00000071932 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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Spocd1B1ASB6 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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Spocd1B1ASB6 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Spocd1B1ASB6 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Spocd1B1ASB6 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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