Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.6 ms