Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms