Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Prune2-201ENSMUST00000087689 12512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr273-202ENSMUST00000107670 4796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms