Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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Hpf1Q8CFE2 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Olfr183-203ENSMUST00000213465 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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Hpf1Q8CFE2 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hpf1Q8CFE2 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.9 ms