Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc88cQ6VGS5 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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