Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Pfkfb3-201ENSMUST00000028114 4712 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp939-202ENSMUST00000186855 2480 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29028-201ENSMUST00000186297 2166 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Tex14-201ENSMUST00000060835 4763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10744-201ENSMUST00000220184 2706 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Prpf8-202ENSMUST00000102510 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 A630023P12Rik-202ENSMUST00000141420 495 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23151-201ENSMUST00000178061 107 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5698-201ENSMUST00000178317 724 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Plppr1-201ENSMUST00000076670 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Ctnnd1-222ENSMUST00000111696 6281 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45767-201ENSMUST00000212778 4561 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r180-201ENSMUST00000173816 5060 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Ucp2-202ENSMUST00000126534 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Oacyl-201ENSMUST00000115097 3431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp455-202ENSMUST00000120861 2712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp93-202ENSMUST00000108438 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Nucb1-210ENSMUST00000211765 4853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Ntsr1-201ENSMUST00000029084 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42848-201ENSMUST00000201477 2022 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Nsun2-201ENSMUST00000022087 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Trpa1-201ENSMUST00000041447 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Pkib-202ENSMUST00000075992 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1509-206ENSMUST00000215030 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Pnma2-202ENSMUST00000122431 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15834-201ENSMUST00000129740 2097 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Epn2-202ENSMUST00000108711 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6275-201ENSMUST00000118971 1122 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gkn2-201ENSMUST00000032128 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22362-201ENSMUST00000083102 134 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Iars-201ENSMUST00000047363 4396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Emc1-205ENSMUST00000179784 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Mpdz-201ENSMUST00000102830 7512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms