Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.7 ms