Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 AC153975.1-201ENSMUST00000220087 926 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
RxraP28700 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
RxraP28700 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
RxraP28700 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
RxraP28700 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RxraP28700 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms