Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Has2os-203ENSMUST00000165880 638 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm37097-201ENSMUST00000193676 336 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms