Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rrn3B2RS91 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms