Protein–RNA interactions for Protein: B1AUS7

Ssxa1, Protein SSXA1, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxa1B1AUS7 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Ssxa1B1AUS7 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Ssxa1B1AUS7 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Ssxa1B1AUS7 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Ssxa1B1AUS7 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Ssxa1B1AUS7 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Ssxa1B1AUS7 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Ssxa1B1AUS7 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ssxa1B1AUS7 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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