Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Grik3B1AS29 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms