Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms