Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm28594-201ENSMUST00000187022 661 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.8 ms