Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm43766-201ENSMUST00000200590 5417 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Ephb2-202ENSMUST00000105845 10902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Mapk8-203ENSMUST00000111943 1310 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm11874-201ENSMUST00000117437 130 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Map1a-201ENSMUST00000094639 11825 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Unc79-208ENSMUST00000179002 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
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PtprtQ99M80 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Usf3-202ENSMUST00000119746 12708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm44871-201ENSMUST00000207821 497 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Asxl2-202ENSMUST00000111215 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
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