Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Sft2d1Q5SSN7 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Sft2d1Q5SSN7 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Sft2d1Q5SSN7 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Sft2d1Q5SSN7 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Sft2d1Q5SSN7 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Sft2d1Q5SSN7 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Sft2d1Q5SSN7 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Sft2d1Q5SSN7 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
Sft2d1Q5SSN7 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
Sft2d1Q5SSN7 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
Sft2d1Q5SSN7 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
Sft2d1Q5SSN7 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.73
Sft2d1Q5SSN7 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm15866-201ENSMUST00000149048 785 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 1700016L21Rik-202ENSMUST00000189139 629 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Olfr414-202ENSMUST00000192358 4526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm11639-203ENSMUST00000212287 17665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 4930568A12Rik-201ENSMUST00000186117 498 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms