Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Cdh23-201ENSMUST00000073242 10688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Akap13-201ENSMUST00000166315 12543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Kcnj15-201ENSMUST00000037154 5089 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm12237-201ENSMUST00000120158 470 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm15075-201ENSMUST00000122187 477 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm43766-201ENSMUST00000200590 5417 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Olfr1259-202ENSMUST00000214846 4325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm22501-201ENSMUST00000158981 127 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Arhgef9-209ENSMUST00000181987 6222 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 Dnajc6-201ENSMUST00000038207 5258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 Olfr1352-201ENSMUST00000058991 4356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Shank3Q4ACU6 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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