Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Mir6933-201ENSMUST00000184982 81 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms