Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm28118-201ENSMUST00000185957 294 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Olfr876-203ENSMUST00000215287 4474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm15866-201ENSMUST00000149048 785 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Yipf3Q3UDR8 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms