Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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