Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm26355-201ENSMUST00000158220 105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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