Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Rfx1P48377 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Rfx1P48377 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx1P48377 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Rfx1P48377 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx1P48377 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx1P48377 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Rfx1P48377 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx1P48377 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx1P48377 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Rfx1P48377 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Rfx1P48377 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Rfx1P48377 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Rfx1P48377 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Rfx1P48377 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx1P48377 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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