Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Vmn1r173-201ENSMUST00000174055 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxc11P31313 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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