Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Cdh23-201ENSMUST00000073242 10688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 A430072C10Rik-201ENSMUST00000197848 2532 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Vmn2r-ps2-201ENSMUST00000121053 765 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm37040-201ENSMUST00000191740 1824 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PtprmP28828 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtprmP28828 2210414F02Rik-201ENSMUST00000215316 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtprmP28828 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms