Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 AC130547.1-201ENSMUST00000228079 1047 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm23587-201ENSMUST00000157658 84 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Vmn1r173-201ENSMUST00000174055 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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