Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tmf1B9EKI3 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Gm26355-201ENSMUST00000158220 105 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Tmf1B9EKI3 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms