Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm7648-201ENSMUST00000173036 1658 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Zscan5bB2RTN3 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms