Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 AC154313.1-201ENSMUST00000217755 3841 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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