Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm37473-201ENSMUST00000195079 674 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
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Hdac6Q9Z2V5 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
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Hdac6Q9Z2V5 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
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Hdac6Q9Z2V5 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm5426-201ENSMUST00000074615 312 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac6Q9Z2V5 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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