Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm38221-201ENSMUST00000195146 365 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Rabgef1Q9JM13 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Rabgef1Q9JM13 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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Rabgef1Q9JM13 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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Rabgef1Q9JM13 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Rabgef1Q9JM13 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Rabgef1Q9JM13 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Rabgef1Q9JM13 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Rabgef1Q9JM13 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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