Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 1700101O22Rik-201ENSMUST00000187396 339 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp29Q9ES63 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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