Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms