Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Obox4-ps7-201ENSMUST00000196144 505 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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