Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
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PtprtQ99M80 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Rlim-202ENSMUST00000121153 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
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PtprtQ99M80 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 AC154305.1-201ENSMUST00000224443 450 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
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PtprtQ99M80 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
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PtprtQ99M80 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
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PtprtQ99M80 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
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PtprtQ99M80 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
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PtprtQ99M80 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
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PtprtQ99M80 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
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PtprtQ99M80 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
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PtprtQ99M80 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
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PtprtQ99M80 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
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PtprtQ99M80 Mir323-201ENSMUST00000083683 86 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
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PtprtQ99M80 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Pkib-202ENSMUST00000075992 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
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