Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Rfpl4b-201ENSMUST00000179279 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gga3Q8BMI3 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms