Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Nop53Q8BK35 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Nop53Q8BK35 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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Nop53Q8BK35 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Nop53Q8BK35 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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Nop53Q8BK35 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Nop53Q8BK35 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nop53Q8BK35 Gm12515-201ENSMUST00000120116 361 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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