Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pcsk9Q80W65 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms