Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1307-201ENSMUST00000099604 15582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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