Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Olfr616-201ENSMUST00000106886 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 AC113305.1-201ENSMUST00000214664 724 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CtifQ6PEE2 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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