Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Apbb2-204ENSMUST00000159786 6333 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Slc5a7-201ENSMUST00000095712 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gprin3-201ENSMUST00000051065 8339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Scn11a-202ENSMUST00000215718 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Med12-204ENSMUST00000117706 6940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm12427-201ENSMUST00000117719 302 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm26362-201ENSMUST00000158865 315 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm44009-201ENSMUST00000203539 521 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Pax5-201ENSMUST00000014174 8004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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