Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Trex1-201ENSMUST00000061973 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm8623-201ENSMUST00000071573 436 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Tex28-201ENSMUST00000078060 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Lrcol1-201ENSMUST00000100924 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Ighv1-59-201ENSMUST00000103530 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm23840-201ENSMUST00000116950 97 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm12223-201ENSMUST00000135468 528 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 BC021767-202ENSMUST00000136988 905 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm25190-201ENSMUST00000176664 95 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm37929-201ENSMUST00000195116 493 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm37481-201ENSMUST00000195176 403 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm42952-206ENSMUST00000199324 506 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm40319-201ENSMUST00000199785 481 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm44140-201ENSMUST00000204157 675 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 AC155934.1-201ENSMUST00000213802 322 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 AC130829.2-201ENSMUST00000222931 127 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Thyn1-201ENSMUST00000039161 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm9837-201ENSMUST00000057722 731 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Mill2-202ENSMUST00000072415 1075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms